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1、納稅原則先分后稅，合伙企業(yè)以每一個合伙人為納稅義務人，先按照一定的比例和方法分配合伙企業(yè)的應納稅所得額，再按照分配的應納稅所得額進行納稅。

2、稅種差異合伙企業(yè)合伙人是自然人的，繳納個人所得稅；合伙人是法人和其他組織的，繳納企業(yè)所得稅；合伙人為合伙企業(yè)時，則向上穿透。

3、收益區(qū)分合伙企業(yè)對外投資分回的股息紅利，不并入企業(yè)的收入，而應單獨按“利息、股息、紅利所得”應稅項目計繳個人所得稅。

4、虧損彌補有限合伙企業(yè)若有經營虧損，而企業(yè)合伙人本身生產經營有盈利的，不得用合伙企業(yè)的虧損來沖減本企業(yè)的盈利。

5、納稅稅率理論上，自然人合伙人應按5%-35%五級超額累進稅率計繳個人所得稅，實踐中很多地區(qū)按20%征收；對于法人和其它組織，適用25%的企業(yè)所得稅率（實踐中存在爭議，部分地區(qū)免稅，部分地區(qū)不免）。

6、納稅時點合伙企業(yè)當年的所得，無論是分配與否都要繳稅，一般收益的個人所得稅按年計算，分月或者分季預繳，股息紅利類收益需在取得紅利的次月十五日內申報個人所得稅；法人合伙人應在合伙企業(yè)取得紅利的當年，計入企業(yè)應納稅所得額，進行企業(yè)所得稅年度申報。

7、納稅地點個人所得稅的申報地為合伙企業(yè)實際經營管理所在地；居民企業(yè)以企業(yè)登記注冊地為納稅地點。

8、稅收優(yōu)惠證券投資基金類合伙企業(yè)從新三板掛牌企業(yè)取得的股息紅利所得，持股1個月-1年的減按50%計入應納稅所得額，超過1年的免征收個人所得稅，其余合伙企業(yè)不免稅。